Οι εκπλήξεις δεν έλειψαν στους τρεις πρώτους ομίλους που ολοκληρώθηκαν στο Κύπελλο της Ελλάδας αφού τρεις ομάδες της Super League έμειναν εκτός θεσμού.
Συγκεκριμένα στον 4ο όμιλο ο Λεβαδειακός πέρασε νικηφόρα από την έδρα του Εθνικού Γαζώρου με σκορ 1-0 ενώ Πλάτανιάς και Ηρακλής έμειναν στο 0-0. Οι Βοιωτοί και ο Γηραιός πήραν το εισιτήριο για την κλήρωση της Παρασκευής.
Στον 6ο όμιλο Βέροια και Απόλλων Σμύρνης πήραν το εισιτήριο για την επόμενη φάση μετά το μεταξύ τους 1-1 αφήνοντας εκτός Ερμιονίδα και Εργοτέλη με τους Κρητικούς να χάνουν μάλιστα 2-0 εκτός έδρας.
Τέλος στον 7ο όμιλο η Καλλονή παρά το εντυπωσιακό 5-0 επί του Αιγινιακού αποκλείστηκε αφού Τύρναβος και Αστέρας Τρίπολης έμειναν στην ισοπαλία 1-1 περνώντας στην επόμενη φάση.
